En el año 1877 se estableció la Junta Universitaria de Guayas, la cual dirigida por ese entonces por el Dr. Francisco Campos Coello, Rector de del Colegio Nacional San Vicente acordando comenzar a funcionar la Facultad de Ciencias Medicas del Guayas, debiendo iniciar el estudio de Medicina, dictándose las clases en el Colegio San Vicente, siendo designado como primer Decano el Dr. Alejo Lascano Bahamonde.

El día 7 de noviembre de 1877 (siendo el Rector de la Universidad el Dr. Francisco Campos) se inauguran las clases de medicina, la cual ha quedado como la fecha de fundación de nuestra Facultad de Ciencias Medicas.

Sus primeros profesores y doctores:

Alejo Lascano Bahamonde Profesor en Parasitología Externa (primer decano)
Federico Mateus Profesor en Parasitología Interna (segundo decano)
Pedro Boloña Profesor en Fisiología y Obstetricia (tercer y sexto decano)
Manuel Pacheco Profesor en Anatomía (quinto decano)
Julian Coronel Profesor en Terapéutica, Materia Medica e Higiene (séptimo decano)
Nicolás Fuentes Profesor en Química Orgánica

Los primeros alumnos y también fundadores fueron:
L
León Becerra, Guillermo Gilbert Estrada, Ovidio Lascano, Leónidas del Campo, Alcides Murillo Durán, José Navarrete, Francisco Zambrano, Manuel de los Reyes Elizalde, Joaquín Martinez León.

En la actualidad nuestra facultad cuenta con las Escuelas de Medicina, Obstetricia, Enfermería y Tecnología Medica. Presidida por el Decano Dr. Wilson Maitta Mendoza.

La Facultad de Ciencias Medicas se esfuerza por desarrollar una actividad educativa con información científica avanzada y actualizada, cultivando los valores de solidaridad y compromiso ético, moral, de honestidad y de lucha, fortaleciendo la personalidad del estudiante como Ser Humano y como profesional de la salud